升级大本营虽然是游戏发展的必经之路，但盲目追求高等级可能会带来不少麻烦。升级大本营需要消耗大量资源，尤其是金属、晶体和重氢，这些资源本可以用于建造舰队或强化舰船。如果资源储备不足，强行升级会导致发展停滞，甚至影响日常采集和战斗效率。
高等级大本营会解锁更高级的舰船和建筑，但这些新内容往往需要更多资源和技术点支持。如果没有提前准备好足够的蓝图或技术值，解锁的新功能可能无法立即投入使用，反而造成资源浪费。高本阶段对舰队规模和强度要求更高，若舰队实力跟不上，很容易在PVP或攻城战中处于劣势。
高等级建筑和舰队的日常消耗更大，比如修理费用、燃料补给等。如果资源产量跟不上消耗，可能会陷入越升级越穷的尴尬局面。尤其是新手阶段，过早升到高本会让资源管理变得非常吃力，甚至被迫放弃部分战斗或采集计划。高本玩家在匹配机制中更容易遇到实力更强的对手或联盟。系统会根据大本营等级调整对手难度，如果舰队和科技水平没有同步提升，可能会频繁遭遇压制。这不仅影响游戏体验，还可能拖慢整体发展节奏。建议在升级前评估自身实力，确保舰队、资源和科技都能跟上大本营的进度。
升级大本营需要较长的等待时间，尤其是后期阶段。如果加速道具不足，可能会占用大量计划圈或工程船，影响其他任务的执行。合理规划升级顺序，优先提升资源生产和舰队实力，才能避免因盲目升本而陷入被动。稳扎稳打往往比快速冲本更有利于长期体验，尤其是在资源管理和战斗平衡方面。
